Un año después de que BMW Motorrad inaugurase su trayectoria en el mundo de las dos ruedas con la R 32 y la R 27 (una modificación dela primera) la firma bávara presentó al mundo en el Salón de la Moto de Berlin su tercer modelo de dos ruedas, la R 39.
Se trataba de la primera motocicleta monocilindrica de cuatro tiempos, con 247 cc y válvulas de cabeza, de la firma bávara.
Con una velocidad máxima de 100 km/h, la R 39 registraba una cifra muy baja de consumo, que impulsó las ventas del modelo.
Ya en 1925, se inició su comercialización en el mercado alemán por un valor de 1,870 marcos de la época, un precio al alcance de pocos pero considerablemente más reducido que el de la R 32 y la R 37, con costes de 2,200 y 2,900 marcos, respectivamente.
Este modelo incluso superó a la BMW R 32 en prestaciones deportivas, pues su producción en serie solo duró dos años, tiempo en el que se adquirieron 855 unidades, lo que supuso un rotundo éxito en ventas de tales ejemplares.
Cuando este modelo se comenzó a vender, tenía un increíble precio inicial de 12.995,00 €.
Ese mismo año, la R 39 hizo su aparición en competición con el piloto oficial de BMW Josef Stelzer en el Campeonato Alemán de 250 cc, donde se alzó al final de la temporada con el primer puesto de la clasificación general.